全基因组选择的概念
肉牛全基因组选择是指利用覆盖在全基因组上的遗传标记信息对个体进行遗传评估，计算基因组估计育种值，根据基因组估计育种值排名选择留种的一种方法。利用全基因组选择技术不仅可以获得更高的育种值估计准确性，而且可对种牛进行早期选择，大大缩短世代间隔，加快遗传进展，并能显著降低育种成本，有效解决我国肉牛育种性能测定体系不完善，表型数据极度短缺的问题。
国家肉牛遗传评估中心构建了我国第一个肉牛基因组选择参考群，其中包括西门塔尔牛1570头，和牛483头。数据包含生长发育、育肥、屠宰、胴体、肉质、繁殖6类87个重要经济性状。
资源群体规模
国家肉牛遗传评估中心依托中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牛遗传育种创新团队构建了我国第一个肉牛基因组选择参考群，其中包括西门塔尔牛1570头，和牛483头。数据包含生长发育、育肥、屠宰、胴体、肉质、繁殖6类87个重要经济性状。
参考群体中SNP效应估计方法
技术积累
1、完全自主知识产权的适合我国肉牛（西门塔尔牛）群体的重要经济性状基因组育种值的评估方法，包括BayesFA、BayesFB和BayesFC。
2、相配套的应用Bayes的自适应多链并行全基因组育种值估计技术（运算速度提高了10倍以上）。
3、根据国内肉用种公牛育种数据的实际情况，制定肉牛基因组选择指数进行肉牛的选育工作，有效的提高了选择的准确性（准确度达0.41-0.74），与发达国家的结果在同一水平。
4、全国首个基于Illumina Bovine 770K SNP芯片的基因型数据库和肉牛全基因组选择计算分析平台。
肉牛基因组选择服务流程
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